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DrugComb癌癥聯(lián)合用藥數據門(mén)戶(hù)

發(fā)布者: 發(fā)布時(shí)間:2021-07-01瀏覽次數:1954

訪(fǎng)問(wèn)鏈接:https://drugcomb.org/


簡(jiǎn)介:

藥物聯(lián)合治療具有提高療效、降低劑量依賴(lài)毒性和防止出現耐藥性的潛力,芬蘭分子醫學(xué)研究所、赫爾辛基大學(xué)于2019年首次發(fā)布可免費訪(fǎng)問(wèn)的癌癥聯(lián)合用藥數據門(mén)戶(hù)DrugComb(https://drugcomb.org/),可用于存放、分析和可視化用戶(hù)自己的藥物組合篩選數據。自首次發(fā)布以來(lái),DrugComb 不斷更新數據資源的覆蓋范圍以及web服務(wù)器功能,成為研究多種疾病藥物敏感性最全面的網(wǎng)絡(luò )資源,Shuyu Zheng等人將更新報告發(fā)表于Nucleic Acids Research

DrugComb是第一個(gè)用于存儲藥物組合數據集和分析它們的網(wǎng)絡(luò )門(mén)戶(hù),包括存放、檢索、分析注釋和可視化等。本次DrugComb的重要更新內容包括:(1)人工管理和協(xié)調更全面的藥物組合和單一療法篩選數據,包括癌癥以及瘧疾、COVID-19等其他疾病;(2)評估藥物組合的敏感性和協(xié)同作用的增強算法;(3)用于可視化給定癌癥樣本的藥物或藥物組合作用機制的網(wǎng)絡(luò )建模工具;(4)最先進(jìn)的機器學(xué)習模型預測藥物組合的敏感性和協(xié)同作用。

DrugComb是第一個(gè)在線(xiàn)制作藥物組合預測的綜合性工具,提供訪(fǎng)問(wèn)并發(fā)的高通量藥物組合以及單一療法藥物篩選數據集,提供了藥物組合的網(wǎng)絡(luò )建模,還提供了一個(gè)機器學(xué)習模型用于在單劑量水平預測細胞系的給定藥物組合。目前DrugComb專(zhuān)注于細胞毒性和激酶抑制劑等小分子藥物,而免疫治療和基因治療藥物基本缺失,未來(lái)將不斷提高數據覆蓋面,以及更新藥物組合及分析工具,也許DrugComb中的高質(zhì)量數據將成為開(kāi)發(fā)更穩健和預測性更強的機器學(xué)習模型的基準。


參考資料:

DrugComb update: a more comprehensive drug sensitivity data repository and analysis portal

https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkab438/6290546

Nucleic Acids Res | DrugComb更新:更全面的藥物敏感性數據存儲和分析門(mén)戶(hù) https://mp.weixin.qq.com/s/adQzzAifi8iDsImYhahkHQ


如有問(wèn)題,可聯(lián)系:

資源建設部:葛老師  025-86185504  getao@cpu.edu.cn


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